Forskningsgruppen for Biofilminfektioner

I Forskningsgruppen for Biofilminfektioner under Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Odense Universitetshospital, arbejder vi med klinisk og eksperimentel forskning i mikrobiologi mhp. at udvikle nye behandlingsmetoder, diagnostiske tests og medicinsk udstyr i samarbejde med hospitalsafdelinger og industrien. Der ud over arbejder vi med basalvidenskabelig forskning i infektionspatogenese hvor vi anvender infektionsmodeller i cellekulturer og dyr.

Billeder medarbejdere

Medlemmer

Thomas Emil Andersen, lektor, seniorforsker, ph.d.
Rune Micha Pedersen, speciallæge, klinisk lektor, ph.d.
Kristian Stærk, læge, ph.d., postdoc
Katrine Pilely, cand. scient, ph.d., postdoc
Jens Sivkær Pettersen, cand.scient, ph.d., postdoc
Line Lundegård Bang, cand.scient.san, bioanalytiker
Ditte Tornby, cand.scient, ph.d. studerende
Jannie Søvsø Hjelmager, cand.scient., forskningsassistent
Julie May Jensen, dyretekniker

Vi samarbejder med Forskningsenheden for Molekylær Mikrobiologi ved SDU.

Læs om blærebetændelse på vores hjemmeside: https://bagomblaerebetaendelse.dk/

Forskning

Fremmedlegemeinfektioner er et stadigt stigende problem og en hyppig årsag til hospitalsinfektioner. I forskningsgruppen anvendes in vitro infektionsmodeller til at undersøge adhæsion og vækst af bakterier på medicinsk udstyr, særligt katetre. Ved præcist at efterligne forholdene i eksempelvis blodbanen eller blæren, kan vi undersøge, hvordan bakterier interagerer med venekatetre eller urinvejskatetre og giver anledning til kateterrelaterede infektionssygdomme.

Ud over kateter flowmodeller anvendes cellekultur infektionsmodeller og infektionsmodeller i mus, grise og får, som led i gruppens forskning.

I foråret 2020 udvidede gruppen desuden sine aktiviteter til at omfatte eksperimentel virusforskning, hvor vores erfaringer med in vitro cellekultur infektioner er bragt i anvendelse.

Gruppens primære akademiske samarbejdspartnere omfatter OUH afdelingerne for Hjerte- Lunge og Karkirurgi samt Urinvejskirurgi (Afd. T og L), Tromboseforskningsenheden ved Sydvestjysk Sygehus, Forskningsenheden for Cancer og Inflammationsforskning (SDU) og Mikrobiologigruppen under Institut for Biokemi og Molekylærbiologi (SDU). Derudover en række virksomhedspartnere indenfor medico- og farmaindustrien.

Igangværende forskningsprojekter

Multi Bacteria Sensing to Enhance Wound Healing - MbSens

I dette projekt, som støttes af EU og Innovationsfonden, samarbejder vi med Dansk Fundamental Metrologi under DTU (DK), virksomheden LightNovo ApS (DK) og virksomheden Standa (LT) om at udvikle et miniature Raman spektrometer. Det håndholdte spektrometer udvikles til at kunne identificere bakterier direkte i sår, som et redskab til hurtigt at identificere begyndende sårinfektion. Svage patienter og patienter med svækkede immunforsvar er udsatte for sårinfektioner, som hvis de opdages for sent kan føre til amputation eller død. Derfor er hurtig påvisning af begyndende infektion essentielt. Med teknologien der udvikles i dette projekt , håber vi i teamet at kunne udruste læger med et instrument som hurtigt kan give en indikation af, om der er problematiske bakterier i såret.

Projektet støttes af EU EUREKA Eurostars programmet og forløber i perioden marts 2023 – august 2025.

Telemonitoring of home dialysis utilizing a smart biomimetic arteriovenous graft - TELEGRAFT

TELEGRAFT er et multi-disciplinært projektsamarbejde mellem 10 partnere fra Tyskland, Litauen, Portugal, Spanien, Sverige og Danmark. Målet med projektet er at udvikle en vævs- og blodkompatibel kunstig blodåre som kan anvendes ved dialyse. Behandling af dialysepatienter kræver hyppig adgang til blodbanen, og her anlægges hos nogle en kunstig blodåre som kan tåle de mange kanylestik som dialysen kræver. Der er dog problemer med nuværende kunstige blodårer som ofte genkendes som fremmed i kroppen og derved giver anledning til inflammation, vævsindvækst, blodpropper og infektion. I dette EU-støttede projekt forsøger vi at løse disse problemer gennem brug af ny materialeteknologi.

Projektet er støttet med 4.8M€ af EU og forløber i perioden september 2022 til december 2027.

Covidsmitte

I dette projekt har vi siden starten af COVID-19 pandemien arbejdet på at afdække smitterisiko blandt covid-smittede hospitalspatienter og borgere, samt analysere effekten af COVID-19 vacciner. I projektet har gruppen etableret ét af DK’s eneste viruslaboratorier godkendt til at dyrke og arbejde eksperimentelt med SARS-CoV-2. Der arbejdes i projektet med dyrkningsassays herunder plaque assay som anvendes til at estimere virusindholdet i prøver fra specifikke patientgrupper og borgere. Projektet har gennem pandemien bidraget til at vurdere hvorvidt indlagte patienter reelt bærer smitsom virus.

Projektet har i perioden 2020-2023 modtaget støtte fra Novo Nordisk Fonden, Region Syddanmark og statens ekstraordinære fond til corona-relateret forskning og innovation.
https://novonordiskfonden.dk/da/nyheder/7-nye-projekter-faar-del-i-novo-nordisk-fondens-akutte-coronavirus-pulje/

Projektgruppen modtog i april 2023 en ny bevilling på 997.000 kr. fra Region Syddanmark til forskningsprojektet "Undersøgelse af smitsomhed hos patienter med viral luftvejsinfektion mhp. optimering af isolationsstrategi". Her analyserer projektgruppen prøver fra patienter med COVID-19, RS-virusinfektion og influenzainfektion for at afdække smitterisici.

SVEET - Sugar-modified Vaccine Epitopes; Exploration and Translation

I dette projekt samarbejder vi med SDU-spinoff virksomheden GlyProVac, det tyske forskningsinstitut Fraunhofer (DE) og virksomheden Epitopic GmbH (DE) om at udvikle en vaccine mod tilbagevendende blærebetændelse (cystitis). I projektet udnyttes at overfladen på bakterier indeholder særlige glykosyleringer, som, hvis dette udnyttes i vaccineudvikling, vil kunne forbedre immunresponset over for bakterien. Til test af vaccinen anvendes gruppens grisemodel for blærebetændelse.

Projektet er støttet af EU’s Eurostars program og forløber i perioden forår 2021 – forår 2024.

https://dagensmedicin.dk/forskere-faar-millioner-til-udvikling-af-vaccine-mod-blaerebetaendelse

Udvikling af ny behandling mod Clostridium difficile

Projektet samler for første gang afdelingens kompetencer inden for klinisk og eksperimentel forskning i tarminfektioner og sigter efter at belyse patogenesen bag Clostridium difficile tarminfektion med henblik på udvikling af nye behandlingsmetoder. Infektioner med C. difficile er et stort problem, særlig på hospitaler, da bakterien er resistent over for flere gængse antibiotika. Patienter, som pga. antibiotikabehandling mister deres naturlige, sunde tarmflora, er i risiko for at blive koloniserede med C. difficile da den, som den eneste, kan overleve behandlingen. Derved risikerer patienter at blive kronisk inficerede med bakterien, hvilket kan have store konsekvenser for patientens helbred. C. difficile er svær at dyrke og undersøge i laboratoriet, bl.a. pga. dens særlige krav til iltfrie forhold i omgivelserne. Af den grund ved man relativt lidt om bakterien. I projektet udvikles en særlig anaerob (iltfri) tarminfektionsmodel som nøje efterligner forholdene i tyktarmen. Med denne model kan projektteamet studere C. difficile’s kolonisering af tarmepitel under de korrekte forhold. Dette åbner op for test af nye behandlingsmetoder, som sigter mod at fjerne bakterien fra tarmen og samtidig understøtte en genetablering af den naturlige tarmflora. Projektet er støttet af MICA fonden og udviklingen af den anaerobe flowmodel støttes af Region Syddanmarks og SDU's proof-of-concept midler.

Nyligt afsluttede forskningsprojekter

Vancomycin-resistant enterococci: intestinal colonization, transmission and epidemiology

Projektet anvender tarminfektionsmodellen omtalt ovenfor til at afdække VRE-bakteriens evne til at kolonisere menneskets tarm. Det antages, at én af grundene til at denne bakterie så effektivt spreder sig blandt hospitalspatienter, er dens evne til hurtigt at kolonisere tarmen når patienten er i antibiotikabehandling. Med avancerede tarmepitel flowmodeller undersøges dette for første gang.

Projektet modtog støtte fra OUH og Region Syddanmark.

Urinary tract infections in patients with neurogenic bladder: Elucidation of pathogenesis for improved diagnosis and treatment

Projektsamarbejde med OUH’s Urinvejskirurgisk Afdeling L, Tromboseforskningsenheden ved Sydvestjysk Sygehus og Coloplast A/S.

I projektet belyses grundlæggende urinvejsinfektionspatogenese ifm. recidiverende blærebetændelse med særlig fokus på kateterbrugere og patienter med neurogen blære.

Projektet modtog støtte fra Region Syddanmark og Coloplast A/S.

BacSens

Projektsamarbejde med Dansk Fundamental Metrologi under Nano-DTU, BacAlert IVS og art photonics GmbH. I BacSens udvikles et apparat som muliggør øjeblikkelig identifikation af patogene bakterier baseret på Raman spektroskopi.

Projektet modtog støtte af EU gennem Eurostars EUREKA programmet.
Se artikel om BacSens i Ingeniøren her.
Læs BacSens pressemeddelelse her.

pURIcat

Projektsamarbejde med Biomodics ApS (DK) og Venair Iberica SA (ES).
I projektet udvikles nye, innovative antimikrobielle ballonkatetre til infektionsfri drænage af urinvejene.

Projektet modtog støtte fra EU’s Horizon 2020 Eurostars program.